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本发明公开了一种与莲根状茎膨大性状主效QTL紧密连锁的SNP分子标记及其应用，所述主效QTL位点位于1号连锁群；其区间范围为10.430cM～11.043cM；所述主效QTL位点连锁的SNP分子标记为3个，分别为SNP1～SNP3，其核苷酸序列如SEQIDNO：1～3；其中，各标记序列中第251位碱基均为多态性位点，所述分子标记SNP1～SNP3的多态性位点分别为T/C、C/T、T/G。本发明首次...
近日，山东省农业科学院蔬菜研究所鳞茎类蔬菜育种与栽培创新团队洋葱课题组在Frontiers in Plant Science（IF=6.627；JCR1区，中科院2区）发表了题为“Construction of a high-resolution genetic map and identification of single nucleotide polymorphism markers rel...
江西省农业科学院蔬菜花卉研究所成果：辣椒熟性SNP分子标记及其应用
辣椒 SNP 分子标记
2023/3/31
本发明公开了辣椒熟性SNP分子标记及其应用，利用本发明提供的分子标记及其扩增引物，结合特定的限制性内切酶处理，可在子叶期快速、准确筛选出特早熟辣椒，实现辣椒熟性育种的分子标记辅助选择，提高育种选择效率，在辣椒熟性育种中具有重要应用价值。专利号：ZL201810555673.1
对保存在国家种质武汉水生蔬菜资源圃内来自国内外不同地区的19 份豆瓣菜种质资源的8 个农艺性状进行调查分析，并利用SLAF-seq 技术对豆瓣菜种质资源进行简化基因组测序，研究其遗传多样性。结果表明：质量性状（叶色、茎色、顶端小叶形状）变异不明显；数量性状（顶端小叶长、顶端小叶宽、株高、茎粗、叶柄长）变异系数较低（7.69%～16.45%），说明数量性状的变异范围较窄，但仍存在具有优良性状的资源，...
利用萝卜Ogura-CMS 保持系和恢复系育性恢复基因Rfo 的序列，开发了基于高通量竞争性
等位基因特异性PCR（KASP）分型技术的SNP 标记：Rfo-SNP1。利用该标记对24 个萝卜品种的304 个
单株进行了育性恢复基因Rfo 的基因型鉴定，其中289 株获得基因分型结果，占整个群体的95.07%。从
分型结果看，育性恢复基因Rfo 的基因型为rfrf 的有110 株（占36.1...
根据不同长度或不同碱基序列的DNA 片段的熔解温度（Tm）不同的原理，将酶切扩增多态性序列（cleaved amplified polymorphic sequence，CAPS）与熔解曲线（melting curve，MC）技术相结合，建立了CAPS-MC 技术，从而实现SNP 分子标记基因分型。通过菜薹‘L58’和紫菜薹‘ZCT095’的基因组重测序数据与白菜基因组的参考序列（‘Chiifu-...
辣椒转录组SNP挖掘及多态性分析
辣椒 转录组 EST-SNP CAPS
2014/2/26
利用SNP分析软件从辣椒（Capsicum annuum L.）251 068条Unigenes中筛选出18 159个SNP，其中有1 781个SNP位点被匹配在1 291个注释基因上，基因功能分类和代谢途径分析表明，其中有853个基因参与初生代谢（28.7%）、细胞代谢（17.3%）、生物合成过程（15.7%），另有125个（9.7%）基因序列参与新陈代谢途径，53条（4.1%）序列参与次生代谢...
以10 份大白菜杂交种及其亲本为研究对象，基于NCBI 基因组数据库中EST 序列信息，应用SSR 标记及高分辨 率溶解曲线技术筛选出用于大白菜杂交种纯度鉴 定的SNP 位点及复合 SSR 位 点，并根据 高通量分子检测技术 种子纯度鉴定的需要 ，对单粒种子育苗条件、单株植株提取 状态、快速DNA提取方法、复合PCR 体系的建立等关键 技术进行了摸索及优化。结果显示：经过48 h 破壳状态的单粒种...