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线粒体基因的表达、生物生成和功能实现主要依赖于核基因编码蛋白。这一过程主要通过转录后水平进行调控，包含了广泛的内含子剪接事件。在高等植物中，绝大多数线粒体内含子属于能够自我剪接的II类内含子。然而，由于植物线粒体基因的异质性，其内含子失去了自我剪接的能力，因而必须依靠核编码的蛋白质因子来辅助完成剪接过程。这些剪接因子参与内含子剪接的特异性高度可变，一些剪接因子（即特定剪接因子）参与一个或少数几个内...
南京农业大学农学院《Nucleic Acids Research》发表张文利教授团队“The roles of DNA methylation on pH dependent i-motifs (iMs) formation in rice”（图）
张文利 基因 解析
2024/6/11
2024年1月8日，农学院张文利课题组在 “Nucleic Acids Research”上发表了题为“The roles of DNA methylation on pH dependent i-motifs (iMs) formation in rice”的研究论文。该研究是在前期的研究基础之上（Nucleic Acids Res 2022, 50:3226-3238），再次利用iM-IP-s...
2023年6月8日，中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所马迎飞课题组在国际期刊核酸研究（Nucleic Acids Research）发表题为 “Global transmission of broad-host-range plasmids derived from the human gut microbiome” 的文章。该工作深度分析并揭示了大量人肠道质粒，首次鉴定出一系列未知的宽...
DNA加合物损伤可以由多种外源因子诱导产生，包括阳光中的紫外线、顺铂等化疗药物、香烟和汽车尾气中的苯并芘以及来自霉变食物的黄曲霉素B1等。它们会干扰DNA复制和转录，诱导突变和细胞死亡，最终导致癌症及其它疾病。
近日，新疆农业科学院核技术生物技术研究所陈果副研究员在国际期刊《Nucleic Acids Research》（IF = 19.160）杂志在线发表了题为《A novel active transposon creates allelic variation through altered translation rate to influence protein abundance》的研究论文。...
近日，浙师大生化学院邵勇研究员课题组以“Switching G-Quadruplex to parallel duplex by molecular rotor clustering”为题在Oxford University Press旗下的Nucleic Acids Research上发表研究成果。Nucleic Acids Research是国际核酸研究领域最具影响力的刊物，最新影响因子为19...
李津臣、赵贵虎、贺小进团队在《Nucleic Acids Research》发表人类重大疾病基因组剪切变异数据库及分析平台SPCards（图）
老年疾病 生物信息学 帕金森病 孤独症
2023/5/26
近日，英国牛津大学出版社旗下的核酸及生物信息学领域权威期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research，IF=19.16）在线发表了中南大学湘雅医院国家老年疾病临床医学研究中心/生物信息中心李津臣教授、赵贵虎助理研究员和安徽医科大学第一附属医院贺小进教授的最新研究成果《Performance evaluation of differential splicing analysis m...
浙江大学生命科学研究院2022年5月30日黄俊实验室在Nucleic Acids Research上发文报导了RNF4调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制（图）
黄俊 复制叉翻转 维持基因 分子机制
2022/10/25
2022年5月30日，浙江大学生命科学研究院黄俊实验室在Nucleic Acids Research杂志上在线发表了题为“RNF4 controls the extent of replication fork reversal to preserve genome stability”的研究论文，揭示了细胞调控复制叉翻转及维持基因组稳定性的分子机制。
山东大学微生物技术国家重点实验室（研究院）侯进教授课题组在Nucleic Acids Research发表CRISPR转录调控工具开发的新进展（图）
山东大学微生物技术国家重点实验室（研究院） 侯进 Nucleic Acids Research CRISPR 转录调控工具 酿酒酵母
2022/12/23
近日，山东大学微生物技术国家重点实验室祁庆生团队侯进教授在Nucleic Acids Research发表“CRISPR-mediated protein-tagging signal amplification systems for efficient transcriptional activation and repression inSaccharomyces cerevisiae”，开...
浙江大学农业生物技术学院农学院李飞教授团队在Nucleic Acids Research报道昆虫综合基因组数据库InsectBase 2.0（图）
李飞 昆虫综合基因 数据库InsectBase 2.0
2022/10/14
2021年11月18日，国际权威期刊Nucleic Acids Research（中科院JCR期刊1区，五年影响因子为15.542，）在线发表了农学院李飞教授团队题为“InsectBase 2.0: a comprehensive gene resource for insects”的研究论文。该研究通过广泛收集与分析昆虫基因数据，构建起目前昆虫学领域最为广泛、全面、标准化的数据平台，为昆虫学各领...
生命活动需要氧化反应提供能量，这一过程同时会产生活性氧物质（ROS）。ROS能诱导多种DNA氧化损伤，其中最常见的是8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine (OG)，被视为氧化压力的标志物。如果没有被及时修复，OG可能引起G→T突变，与多种癌症、神经退行性疾病和衰老相关。除此之外，OG也有类似于表观遗传修饰的作用，可以通过几种不同的方式调控基因表达，例如OG的修复中...
Alastair Murchie-陈东戎课题组《Nucleic Acids Research》报道Twister核酶的新生物学功能（图）
环状RNA 陈东戎课题组 生物学 肠血吸虫病
2023/4/14
核酶指有催化功能的RNA。Twister核酶是生物信息学揭示的天然自剪切核酶，分布广泛且催化效率高，被应用于核糖开关、环状RNA表达载体等分子工具的研究，但目前Twister核酶的天然生物学功能未知。
浙江大学农业生物技术学院农学院陈云/马忠华团队在Nucleic Acids Research上发文揭示病原真菌组蛋白H3K27甲基化识别新机制（图）
陈云 马忠华 病原真菌组蛋白 H3K27甲基化识别
2022/10/14
2021年9月27日，Nucleic Acids Research在线发表了农学院马忠华团队题为“Fusarium BP1 is a reader of H3K27 methylation”的研究论文。该研究发现了一个新的组蛋白H3K27me3阅读器BP1，并揭示了BP1参与调控病菌生长和致病的机制，为真菌病害防控提供了新的潜在药靶。
近日，应“核酸研究”高级执行主编Julian Sale的邀请，中南大学湘雅医院国家卫健委肿瘤蛋白质组学重点实验室陈永恒教授团队在国际权威学术期刊Nucleic Acids Research（IF=16.97）上发表题为“Toward a mechanistic understanding of DNA binding by forkhead transcription factors and it...
环状RNA(CircRNAs)在大脑中高度表达，在神经元分化过程中其表达增加。在发育中的小鼠大脑中调节环状RNA的因素是未知的。NOVA1和NOVA2是神经丰富的RNA结合蛋白，在选择性剪接中的作用得到了很好的描述。从RNA-seq数据中提取的CircRNA图谱显示，在Nova2基因敲除小鼠的胚胎皮质中，全局CircRNA水平降低，但在Nova1基因敲除小鼠中没有。对分离的缺乏NOVA2的抑制性和...